На сьогоднішній день історичний музей включає в себе наступні відділи:
1. Історичний музей (пр. Д. Яворницького, 16)
2. Діорама «Битва за Дніпро» (пр. Д. Яворницького, 16)
3. Меморіальний будинок-музей Яворницького (пл. Шевченка, 5)
4. Музей «Літературне Придніпров’я» (пр. Д. Яворницького, 64)
5. Музейний центр О.П. Блаватської та її родини (вул. князя Ярослава Мудрого, 11)
6. Музей історії і розвитку самоврядування Дніпропетровської області (пр. О. Поля, 2)
7. Музей «Громадянський подвиг Дніпропетровщини під час АТО» (пр. Д. Яворницького, 16)
